El Museo, que es va crear com a museu de pintura i escultura, té també col·leccions importants de dibuixos (més de cinc mil), grabats (dos mil), monedes i medalles (prop de mil), i gairebé dos mil peces d'arts sumptuàries o decoratives. L'Escultura, alhora, està representada per més de set-centes peces i per una quantitat menor de fragments escultòrics. Però la col·lecció de pintura, amb la seva enorme riquesa, en quantitat (vuit mil sis-centes pintures) i en qualitat, ha fet ombra a la importància de les altres col·leccions. Tot i així, a causa de la limitació d'espai, el Prado només pot exhibir, en les seves dues seus, la selección més rica possible de les seves pintures (una sèptima part aproximadament) i de les seves escultures.